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在进出口贸易中，海关双抬头发票的进项税额抵扣权归属问题存在疑惑。具体而言，当发票上同时显示经营单位和收货单位两个名称时，应由哪一方作为合法主体进行增值税进项税额的抵扣？需要明确相关的税务规定和操作依据。
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海关双抬头发票的抵扣方取决于发票上注明的“购买方”信息。根据中国税法及海关相关规定，进口环节增值税的抵扣权属于进口货物的实际购买方，即海关缴款书（俗称“海关双抬头发票”）上列明的“购买方”名称所对应的单位。
具体而言：
1. 若发票的“购买方”栏明确填写了境内最终收货单位（即实际承担进口税费的单位），则该单位凭此海关缴款书原件，在规定的认证期限内，通过增值税发票综合服务平台进行勾选确认后，即可依法申报抵扣进项税额。
2. 若“购买方”栏填写的是代理进口单位（如报关行或外贸公司），而“备注”栏或合同约定中指明了实际收货单位，则通常需要由代理方将抵扣权益转让给实际收货单位。此时，实际收货单位需凭代理方开具的增值税发票以及海关缴款书复印件等资料进行抵扣，具体操作需符合国家税务总局关于代理进口货物增值税抵扣的相关规定。
3. 若双抬头仅用于报关信息展示，但购买方明确为单一实体，则抵扣权归属该实体。
因此，判断抵扣方的核心依据是发票上“购买方”的法律主体身份。实际操作中，企业应确保合同、付款凭证与海关缴款书信息一致，并严格遵循税务机关的最新抵扣流程，避免因抬头信息不符导致抵扣风险。如有复杂情况，建议咨询主管税务机关或专业财税顾问。
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