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在年度企业所得税汇算清缴期间，某企业集团财务人员对分支机构是否必须由总机构合并汇总纳税存在疑问。该企业总机构与分支机构均实行独立核算，且分支机构在所在地已按规定预缴企业所得税。财务人员不确定，在年度终了后，分支机构是否无需单独进行年度纳税申报，而必须由总机构将所有分支机构的经营情况合并后进行汇总纳税申报。希望明确相关税法规定及具体操作要求。
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税务探索者
根据《企业所得税法》第五十条及其实施条例第一百二十五条规定，居民企业在中国境内设立不具有法人资格分支机构的，应当汇总计算并缴纳企业所得税。因此，分支机构在年度终了时，其企业所得税通常由总机构负责统一计算并汇总纳税，分支机构无需进行独立的年度企业所得税汇算清缴。
具体操作中，实行“统一计算、分级管理、就地预缴、汇总清算、财政调库”的征收管理办法。分支机构应按规定的比例（如当期应纳所得税额的50%）就地按月或按季预缴企业所得税。年度终了后，总机构负责进行年度企业所得税汇算清缴，统一计算包括所有分支机构在内的年度应纳税所得额和应纳所得税额，抵减各分支机构已预缴的税款后，进行多退少补。
需要注意的是，部分特殊行业或企业（如铁路、国有银行等）可能按照国家税务总局的具体规定实行跨地区经营汇总纳税。此外，如果分支机构被认定为“独立纳税人”，则需单独进行汇算清缴，但这属于例外情况。
因此，对于绝大多数不具有法人资格的分支机构而言，年度终了必须由总机构负责合并汇总进行企业所得税纳税申报和清算，这是法定的纳税义务和标准流程。
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