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根据《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函〔2009〕3号）文件规定，实行工效挂钩办法的企业，其实际发放的工资薪金在工资薪金总额增长幅度低于经济效益增长幅度、职工平均工资增长幅度低于劳动生产率增长幅度以内的，在计算应纳税所得额时准予扣除。企业应按“两个低于”和实际发放原则，将实际发放的工资薪金在税前扣除。如果企业当年实际发放的工资未超过经批准提取的效益工资总额，则按实际发放数扣除；超过部分，不得在税前扣除，应进行纳税调整。对于已提取但未实际发放的工资薪金，不得在发生年度税前扣除，在实际发放年度按规定扣除。
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云淡风轻
根据《国家税务总局关于企业工资薪金及职工福利费扣除问题的通知》（国税函〔2009〕3号）规定，实行工效挂钩办法的企业，其实际发放的工资薪金在工资薪金总额增长幅度低于经济效益增长幅度、职工平均工资增长幅度低于劳动生产率增长幅度（以下简称“两低于”）以内的，准予在计算应纳税所得额时据实扣除。
在具体执行中，需注意以下几点：
1. **基数与提取**：企业应按经批准的工效挂钩方案提取的工资总额，作为计算扣除的基数。当年实际发放的工资总额低于提取数的，按实际发放数扣除；超过提取数的部分，当年不得扣除，需进行纳税调增。
2. **“两低于”原则**：税前扣除不仅受提取总额限制，还必须符合“两低于”的宏观调控条件。如果工资增长超过经济效益和劳动生产率的增长，即使未超过提取总额，超出部分也可能不得税前扣除。
3. **实际发放**：准予扣除的工资薪金必须是“实际发放”的，即企业在汇算清缴结束前（次年5月31日前）已向职工实际支付的工资。已计提但未实际支付的部分，应作纳税调增。
4. **备案管理**：实行工效挂钩的企业，需将相关方案报主管税务机关备案。税务机关对不符合规定的工资提取数有权进行调整。
因此，工效挂钩企业的工资税前扣除，核心是依据经批准的挂钩方案提取数、实际发放数以及“两低于”原则三者结合进行判断，确保扣除的合规性。
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